Inaugurada en 1981, ocupa parte del antiguo bautisterio de la Iglesia del Jesús o Tercera Orden y parte de lo que fue el claustro de la Universidad de San Francisco Javier primero, y la sede del Congreso del Estado después, durante más de un siglo Su puerta de entrada se encuentra en la calle 59 y pertenece a la administración regional del Instituto Nacional de Antropología e Historia (INAH)

Entre la colección que se exhibe destaca un lienzo de la Virgen de Iza mal yel retrato del canónigo Joseph Nicolás de Lara, ambos del siglo XVIII; también varios retratos de personajes del pasado siglo, aún no identificados Como obra principal se encuentra "La música celestial", realizada por el pintor yucateco Juan Gamboa Guzmán en 1 884- 1 885. El edificio alberga también a la colección del reconocido escultor Enrique Gottdiener y presenta regularmente exposiciones temporales, principalmente de arte contemporáneo.